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干貨貼：NCBI 上的這些字母都是什么意思？
發(fā)布時(shí)間： 2021-08-23 點(diǎn)擊次數(shù)： 28782次NCBI 上基因前面有個(gè) accession（編號(hào)）分別有 NC、NM、NP、GI、XP、XM、BC、AB、NG、 AJ、AC、AY 和 AF 等等，然后后面是一串?dāng)?shù)字，都是什么意思？？特別是看 Blast 結(jié)果時(shí)，這些編號(hào)到處都是的，根本不知道哪個(gè)才是想要的好么！！
莫慌，今天就給大家理理順！
ACCESSION是NCBI序列數(shù)據(jù)中我們常用到編號(hào)（另一個(gè)是GI）。ACCESSION形式為CC_#####， 其中 CC 為兩個(gè)字母，其不同組合又可以區(qū)分為蛋白序列、核酸序列或基因組序列，而#為位數(shù)不等的數(shù)字；ACCESSION 后面又會(huì)加版本號(hào)，以 CC_####.#形式表示，最后的尾數(shù)遞增表 示序列信息較之前的版本有所修改。這樣 ACCESSION+版本號(hào)就是一個(gè)*的表示，代表一個(gè)*的序列，而且這個(gè)編號(hào)不會(huì)改變。
以下是幫大家找到的整理表格！具體的各項(xiàng)說(shuō)明及序列來(lái)源說(shuō)明可以查看 NCBI。
一般來(lái)說(shuō)，mRNA 和基因組序列是我們主要的尋找對(duì)象。如果想找標(biāo)準(zhǔn)序列的話，mRNA 就采用 NM_開(kāi)頭的，基因組用 NC_或者 AC_開(kāi)頭的。so easy！
不同的編碼代號(hào)代表不同的意思，如 NM_開(kāi)頭的表示標(biāo)準(zhǔn)序列，XM_表示預(yù)測(cè)的蛋白編碼序列，NR_表示非編碼蛋白的 mRNA 序列，AF 開(kāi)頭的表示克隆序列，BC 開(kāi)頭的表示模板序列......
上面的表格中是一些常見(jiàn)序列的 accession 號(hào)，不過(guò)大家知道 NCBI 中還有很多其他的 accession 號(hào)么？！其中，僅與 RNA 相關(guān)的就有 116 種！不過(guò)，科研人員生存不易，不必在細(xì)節(jié)上作死自己，建議大家按需選擇或者需要時(shí)查詢即可！
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