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臨床M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因輔助治療胰腺導(dǎo)管腺癌
發(fā)布時(shí)間： 2021-11-02 點(diǎn)擊次數(shù)： 1518次胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)是全球七大癌癥相關(guān)死亡原因，也是最常見的人類惡性腫瘤之一。根據(jù)2018年全球癌癥統(tǒng)計(jì)，大約有45.9萬名新確診患者和近43.2萬人死亡患者。由于早期準(zhǔn)確診斷和腫瘤快速進(jìn)展等困難，大量PDAC（胰腺導(dǎo)管腺癌）病例在診斷時(shí)出現(xiàn)臨床晚期或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。因此，開發(fā)新的、可靠的預(yù)后評(píng)估和療效預(yù)測指標(biāo)以進(jìn)一步推進(jìn)針對(duì)性治療具有十分重要的意義。
越來越多的證據(jù)支持浸潤M2巨噬細(xì)胞在胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)的腫瘤進(jìn)展中起關(guān)鍵作用。然而，對(duì)M2巨噬細(xì)胞浸潤和中樞基因(FAM53B)在臨床結(jié)局和免疫治療中的生物學(xué)作用缺乏全面的分析。近期有一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因表達(dá)進(jìn)行研究，以期望能探索出評(píng)估PDAC預(yù)后及療效的新指標(biāo)。
研究人員合并了兩個(gè)PDAC樣本數(shù)據(jù)集，GSE16515和TCGA-PAAD，以研究M2巨噬細(xì)胞分析的潛在作用。使用CIBERSORT算法獲得M2巨噬細(xì)胞圖譜，然后通過WGCNA發(fā)現(xiàn)與M2巨噬細(xì)胞相關(guān)較為顯著的模塊。然后，利用多cox回歸模型進(jìn)一步確定模塊中的候選基因，最終確定5個(gè)關(guān)鍵基因。然后，建立了多基因風(fēng)險(xiǎn)模型和綜合預(yù)后圖。在后續(xù)分析和外部試驗(yàn)組(ICGC-PACA-CA)中驗(yàn)證其預(yù)后價(jià)值。隨后，研究潛在的信號(hào)通路和治療預(yù)測的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分。最后，進(jìn)一步探討FAM53B在預(yù)后預(yù)測、免疫浸潤和免疫治療中的生物學(xué)功能，為PDAC的臨床治療策略提供可靠的見解。
22個(gè)候選基因的LASSO系數(shù)譜
為了進(jìn)一步研究候選基因的預(yù)后價(jià)值，研究人員從TCGA-PAAD項(xiàng)目中提取了表達(dá)數(shù)據(jù)和隨訪信息。在單因素Cox分析的幫助下，鑒定了22個(gè)M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因，具有顯著的預(yù)后價(jià)值。并對(duì)這些hub基因進(jìn)行了Lasso回歸，識(shí)別出PDAC中與預(yù)后相關(guān)的9個(gè)M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因。進(jìn)行多因素COX回歸分析，確定5個(gè)M2巨噬細(xì)胞相關(guān)基因(FAM53B、SPINK2、ABCB4、GH1、INTU)為中心基因，所有這些基因均被認(rèn)為是有益的預(yù)后指標(biāo)(所有HRs <1,表S6)。使用HPA數(shù)據(jù)庫來探索PDAC樣品中的蛋白表達(dá)水平。結(jié)果顯示，相對(duì)于正常樣本，腫瘤組織中的蛋白(ABCB4、FAM53B和INTU)明顯失調(diào)。此外，在低表達(dá)和高表達(dá)基因亞組之間，生存分析顯示，大多數(shù)hub基因mRNA表達(dá)異常導(dǎo)致總體生存時(shí)間顯著不同。
采用ROC分析評(píng)估預(yù)后特征的預(yù)測價(jià)值
綜上所述，建立基于M2巨噬細(xì)胞的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分，可作為預(yù)測PDAC臨床結(jié)局的穩(wěn)健的預(yù)測性生物標(biāo)志物和預(yù)后指標(biāo)，為PDAC的治療管理提供指導(dǎo)。
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